يعتبر قسم الرقابة من أقسام رئاسة الجامعة المستقل ذاتيا بعمله ويرتبط بصورة مباشرة بالسيد رئيس الجامعة وحسب الهيكل التنظيمي لجامعة كربلاء .
يتكون قسم الرقابة والتدقيق الداخلي :
* مدير قسم الرقابة والتدقيق الداخلي
* شعب الرقابة :
1- شعبة التدقيق الحسابي والخطة الاستثمارية
2- شعبة الرقابة الادارية والقانونية
3- شعبة الرقابة على الموجودات
4- شعبة الشؤون العلمية والتسجيل
* هناك شعب للرقابة في جميع الكليات التابعة الى رئاسة جامعة كربلاء
مفهوم الرقابة :
يهدف القسم الى تدقيق جميع العمليات المالية والإدارية والسيطرة على الموارد المالية والإيرادات المتحققة في رئاسة الجامعة والكليات التابعة
لها والتأكد من التزامها بالقوانين والتعليمات والقرارات النافذة وبما يحقق اهداف الرقابة والتدقيق الداخلي .
مهام قسم الرقابة والتدقيق الداخلي :
1- تدقيق حسابات الجامعة قبل وبعد الصرف بما في ذلك الحسابات الختامية وبما يتوافق مع القوانين والأنظمة والتعليمات والمعايير المحاسبية .
2- تدقيق الأوامر الجامعية والإدارية وفق الصلاحيات الإدارية والمالية والعلمية لمستويات الجامعة كافة .
3- القيام بعمليات الجرد المفاجئ لمخازن الرئاسة والكليات ومقارنة النتائج مع الجرد السنوي والسجلات المخزنية مع الأخذ بنظر الاعتبار الحركة المخزنية .
4- تدقيق سجل الذمم المتعلقة بالموجودات الثابتة مع الموجود الفعلي في الأقسام .
5- متابعة حركة المواد التالفة والبطيئة الحركة والمواد التي تم تحويلها إلى مخزن المخلفات والمستهلكات في رئاسة الجامعة.
6- إعداد التقارير الدورية ورفعها إلى رئيس الجامعة .
7- المساهمة في لجان التعيينات والياتها والتأكد من كونها تعمل وفق القوانين السارية .
8- المساهمة بتوزيع التخصيصات المالية بموازنات سنوية ومتابعة أوجه إنفاقها .
9- تدقيق صناديق التعليم العالي بشكل دوري .
10- التأكد من ان عمليات الشراء تتم وفق التعليمات والقوانين الصادرة .
11- تدقيق حسابات الخطة الاستثمارية وفق التعليمات والقوانين .
12- إقامة الدورات التدريبية للموظفين المتعلقة بالحسابات الختامية والتدقيق والرقابة و المخازن حسب مقتضيات مصلحة العمل .