إنتشار جينات hsp65 و mpt64 في بكتيريا Mycobacterium tuberculosis في محافظة كربلاء

رسالة ماجستير

اسم الباحث : هبه سالم جواد

اسم المشرف : هيام عبد الرضا كريم

الكلمات المفتاحية :

الكلية : كلية التربية للعلوم الصرفة

الاختصاص : علوم الحياة علوم الحياة/علم الحيوان - احياء المجهرية

سنة نشر البحث : 2021

تحميل الملف : اضغط هنا لتحميل البحث

الخلاصة

أجريت الدراسة لتسليط الضوء على علاقة الجينين hsp65,mpt64 والإصابة بمرض السل ومدى انتشاره في محافظة كربلاء ، حيث شملت الدراسة 120 عينة من مجموع المراجعين وقد تم جمع العينات من مركز التدرن والامراض الصدرية في محافظة كربلاء (1 تشرين الأول 2020 – 1 أذآر 2021) وأجراء التصبيغ بطريقة Acid-fast stain وفحصها مجهريا ، كان عدد العينات المأخوذة 120 عينة و منها (50 عينة موجبة وبنسبة 41.7%) وعدد الحالات السالبة (70 عينة وبنسبة 58.3%) وصنفت العينات بحسب عينة الإصابة إلى Chronic،Acute،Recurrent ؛ كانت نتائج علاقة نوع الجنس مع نوع البيئة (حضر، ريف) تبين عدم وجود فروق معنوية بين المصابين الذكور من سكنة الحضر والريف و بين الإناث من سكنة الحضر والريف وكذلك اوضحت علاقة التدخين مع بيئة العينة (حضر ، ريف ) عدم وجود فروق معنوية بين المصابين المدخنين وغير المدخنين في الحضر والريف. اوضحت نتائج دراسة علاقة نوع الجنس مع التدخين وجود فروق معنوية بين المدخنين الذكور والإناث حيث سجل الذكور 28 عينة بنسبة مئوية 100% بالمقارنة مع الإناث بصفر عينة وبنسبة 0% وسجل الإناث غير المدخنات إرتفاعاً معنوياَ بـ16 عينة بنسبة 72.7% بالمقارنة مع الذكور بـ6 عينة ونسبة 27.3% و سجل الذكور المدخنين إرتفاعاً معنوياَ بـ28 عينة وبنسبة 82.4% بالمقارنة مع غير المدخنين بـ6 عينة وبنسبة 17.6% وسجلت الإناث غير المدخنات إرتفاعاً معنوياَ بـ16 عينة وبنسبة 100% بالمقارنة مع المدخنين صفر اي بنسبة 0% ؛ وسجلت علاقة نوع الجنس مع فئات مسحات البلغم لمصابين smear-positive sputum بعدم وجود فروقات معنوية بين الفئة +1 لدى الذكور والإناث بينما سجلت الفئة +2 إرتفاعاً معنوياَ لدى الذكور بـ 12 عينة وبنسبة 66.7% مقارنة مع الإناث ب6 عينة وبنسبة 33.3% , في حين سجلت الفئة +3 إرتفاعاً معنوياَ لدى الذكور ب12 عينة وبنسبة 100% مقارنة مع الإناث التي سجلت صفر عينة وبنسبة 0% في حين اوضحت علاقة التدخين مع الفئات المصابة وسجلت الفئة +3 إرتفاعاً معنوياَ لدى المدخنين بـ12 عينة وبنسبة 42.9% تلتها الفئة +2 بـ10 عينة وبنسبة 55.6% ومن ثم الفئة +1 بـ 6عينة وبنسبة 30 % ، بينما كانت عينات مع الفئات المصابة غير المدخنين ان الفئة +1 ذات إرتفاعاً معنوياَ بـ14 عينة وبنسبة 70.0% تلتها الفئة +2 بـ 8عينات وبنسبة 44.4% بينما كانت نسبة الفئة +3 صفر عينة مقارنة مع باقي الفئات الاخرى واشارت نتائج الدراسة علاقة نوع البيئة بالفئات المصابة حيث اشارت إلى وجود فروقات معنوية بين الفئة +1 لدى الحضر 12 عينة بنسبة 60% والريف بـ8 عينة وبنسبة 40% , في حين كانت الفئة +2 في الحضر 12 عينة وبنسبة 66.7% بالمقارنة مع الريف بـ6 عينة وبنسبة 33.3% , وبالنسبة للفئة +3 في الحضر 12 عينة وبنسبة 100% بالمقارنة مع نسبة اصابة الريف 0% كما لوحظت النتائج عند استخدام بادئات متخصصة في الكشف عن البادئات لجين hsp65عن وجود حزمة ناتجة عن عملية التضخم في المسار الاول والرابع والخامس: Recurrent ، المسار الثاني والثالث: Acute ، المسار السادس والسابع والثامن: Chronic والتي تظهر وجود قطعة الـ DNA عند الوزن الجزيئي المتوقع لهذا الموروث الموافق لـ 195 زوجاً قاعدياً و عند استخدام بادئات متخصصة في الكشف عن البادئات لجين mpt64 عن وجود حزمة ناتجة عن عملية التضخم في المسار الاول والرابع والخامس: Recurrent ، المسار الثاني والثالث: Acute ، المسار السادس والسابع والثامن: Chronic والتي تظهر وجود قطعة الـ DNA عند الوزن الجزيئي المتوقع لهذا الموروث الموافق لـ 771 زوجاً قاعدياً ؛ وبينت نتائج الفحص المباشر بإستخدام Acid Fast stain 56 عينة ايجابية بنسبة 50.9% بينما كانت النتائج بإستخدام تقنية الـPCR ايجابية في 50 عينة وبنسبة 45.45% حيث سجلت الحساسية والخصوصية 78% ومدى ثقى يتراوح 64.04-88.47% و 71.67% ومدى ثقى يتراوح 58.56-82.55% على التوالي.

Prevalence of hsp65 and mpt64 genes in bacteria Mycobacterium tuberculosis in Karbala province

Abstract

The study was conducted to illuminate on the relationship of the two genes hsp65 and mpt64 and the incidence of tuberculosis and its prevalence in the Karbala governorate, where the study included 120 samples from the total auditors. Staining by Acid-fast stain and microscopic examination. The number of samples taken was 120 samples, including (50 positive samples, 41.7%) and negative cases (70 samples, 58.3%) The samples were classified according to the injury sample into Chronic, Acute, Recurrent; The results of the relationship of gender with the type of environment (urban, rural) showed that there were no significant differences between the injured males of urban and rural residents and between females of urban and rural residents, as well as the relationship of smoking with the sample environment (urban, rural) showed no significant differences between the injured Smokers and non-smokers in urban and rural areas. The results of the study of the relationship of gender with smoking showed that there were significant differences between male and female smokers, as males recorded 28 samples with a percentage of 100% compared to females with zero samples and 0%, and non-smoking females recorded a significant increase with 16 samples with a percentage of 72.7% compared to males with 6 samples and a percentage of 27.3 Male smokers recorded a significant increase with 28 samples, or 82.4%, compared to non-smokers with 6 samples, or 17.6%, and female non-smokers recorded a significant increase with 16 samples, with a percentage of 100%, compared to zero smokers, i.e. 0%; And the relationship of gender with the categories of sputum smears for smear-positive sputum patients was recorded, with no significant differences between the group +1 for males and females, while the group +2 recorded a significant increase in males with 12 samples at a rate of 66.7% compared with females with 6 samples at a rate of 33.3%, while Category +3 recorded a significant increase in males with 12 samples at a percentage of 100% compared to females who recorded zero samples at a percentage of 0%, while the relationship of smoking with the affected groups was clarified, and category +3 recorded a significant increase in smokers with 12 samples at a rate of 42.9%, followed by category +2 with 10 samples. At a rate of 55.6%, then category +1 with 6 samples and a percentage of 30%, while the samples with the infected groups were non-smokers, the group +1 had a significant increase of 14 samples and 70.0%, followed by category +2 with 8 samples and at a rate of 44.4%, while the percentage of category +3 was zero A sample compared with the rest of the other groups. The results of the study indicated the relationship of the type of environment with the affected groups, as it indicated that there were significant differences between the group +1 in urban 12 samples with a percentage of 60% and rural with 8 samples at a percentage of 40%, while the category +2 in urban was 12 samples at a rate of 66.7 % compared to the countryside with 6 samples, with a percentage of 33% 3%, and for the +3 category in urban 12 samples at 100% compared to 0% in rural areas. The results were also observed when using specialized primers to detect primers of the hsp65 gene for the presence of a package resulting from the inflation process in the first, fourth and fifth paths: Recurrent, path The second and third: Acute, Sixth, Seventh and Eighth Paths: Chronic, which shows the presence of a piece of DNA at the expected molecular weight of this gene corresponding to 195 base pairs. When using specialized primers to detect primers of the mpt64 gene, the presence of a bundle resulting from the amplification process in the first and fourth pathways Fifth: Recurrent, pathways two and three: Acute, pathways six, seven and eight: Chronic, which show the presence of a piece of DNA at the expected molecular weight of this gene corresponding to 771 base pairs; The results of the direct examination using Acid Fast stain showed 56 positive samples with a percentage of 50.9%, while the results using the PCR technique were positive in 50 samples and at a rate of 45.45%, where the sensitivity and specificity recorded 78%, and a confidence range ranging from 64.04-88.47% and 71.67%, and a confidence range ranging from 58.56-82.55% Straight.