الكشف الجزيئي عن بعض الطفرات المسببة لفقر الدم البحري بيتا في محافظة كربلاء

رسالة ماجستير

اسم الباحث : اسلام احمد عبد الصاحب المسعودي

الكلية : كلية التربية للعلوم الصرفة

الاختصاص : علوم الحياة

سنة نشر البحث : 2015

تحميل الملف : اضغط هنا لتحميل البحث

فقر الدم البحري (Thalassemia) هو فقر دم وراثي وهو اكثرا شيوعا في حوض البحر الابيض المتوسط, والمناطق الاستوائية وشبة الاستوائية من افريقيا واسيا ويقسم المرض على حسب السلسلة البروتينية التي يحدث فيها النقص الى: ألفا, بيتا, دلتا بيتا, دلتا وكاما دلتا. ويوجد في محافظة كربلاء اكثر من 600 شخص مصابين بالمرض ينقلون الدم ويتلقون العلاج في المستشفيات المحلية.

تكمن اهمية الدراسة الحالية في التحري عن بعض الطفرات المسببة لفقر الدم البحري بيتا ودراسة المعايير الدموية والتقدير الكمي والنوعي لخضاب الدم وكذلك دراسة العوامل الديموغرافية للعينات المدروسة في محافظة كربلاء المقدسة.

جمعت عينات الدم من (36) مريضاʺ مصاباʺ بالإصابة الكبرى و(20) مصاباʺ بالإصابة الوسطى لفقر الدم البحري بيتا من مركز فقر الدم البحري  في  كربلاء المقدسة و(20) شخصاʺ من الاصحاء مظهريا. تمت دراسة توزيع العينات طبقا لبعض المتغيرات مثل العمر- الجنس – محل السكن – نوع الاصابة- صلة القرابة بين الوالدين- عدد الاخوة و/او الاخوات المصابين لمعرفة تأثير هذه المؤشرات على تباين فقر الدم البحري بيتا في المجاميع المدروسة.

تم تحديد فصائل الدم للعينات المشمولة بالدراسة وتم دراسة العلاقة بين فصائل الدم والنمط المظهري للمرض ووجد ان هناك علاقة دالة احصائيا بين الاصابة الكبرى وفصائل الدم (B,O) وكذلك بين الاصابة الوسطى وفصيلة الدم  .(A)

تم حساب تراكيز خضاب الدم , التحليل لكمي والنوعي لخضاب الدم باستخدام الترحيل الكهربائي لخضاب الدم لتحديد انواعه (HbA,HbA2 and HbF) والنسب المئوية لها وتم الكشف عن فروق معنوية بين المجاميع المدروسة في الانواع الثلاثة المذكورة أنفا لخضاب الدم.

درس تحليل مكونات الدم الشامل (Complete blood picture) للعينات المدروسة وسجلت فروق معنوية في العينات المدروسة ما عدا تعداد خلايا الدم البيض لم تسجل فروق معنوية بين العينات للمدروسة.

تم استخلاص الحامض النووي (DNA) من عينات الدم المشمولة بالدراسة ,وتم اجراء التشخيص الجزيئي لأربع انواع من الطفرات الوراثية المسببة لفقر الدم البحري بيتا وهي :-

IVS1-110(G˃C) ,CD8/9(+G) ,-87 (C˃G) ,CD 41/42(-TCTT)

باستعمال احدى التقنيات المعتمدة على تقنية تفاعل البلمرة المتسلسل (PCR)  والمسمات :- (Amplification Refractory Mutation System ”ARMS”)

بينت الدراسة ان الطفرة IVS1-110 هي من الطفرات الشائعة في العينات المدروسة والتي شكلت (70%)وتم الكشف عن الطفرة CD8/9(+G) لأول مرة في محافظة كربلاء المقدسة حيث بلغت نسبة الاصابة بها (10%) وشخصت الطفرة -87(C˃G) لأول مرة في العراق وبنسبة (20%) .

وكشفت الدراسة ان الطفرة CD 41/42  لم يتم الكشف عنها ضمن العينات المدروسة.

تم دراسة التوزيع الجغرافي للطفرات المشخصة لمعرفة توزيع الطفرات المسببة للمرض ضمن مناطق المحافظة وكان قضاء المركز بالمرتبة الاولى في الطفرات المشخصة كما ونوعا.

اوضحت الدراسة ان اعلى نسبة لدى الاطفال المصابين كانت من اباء تربطهم صلة قرابة , وان اعلى نسبة للإصابة الكبرى كانت من اباء تربطهم صلة قرابة من الدرجة الاولى(وهي ان الاب والام اولاد عم او خال او عمة او خالة) .

اوضحت  الدراسة ان (55.66%) من العينات المدروسة كانوا يمتلكون اخوة و/او اخوات مصابين بالمرض مع وجود نسبة (9.26%) متوفين.

بينت الدراسة ان اعلى نسبة اصابة على مستوى الطراز الجيني هو الاصابة متباينة الزيجة (Heterozygote) بنسبة  (74.07%) وكانت الاصابة  المتماثلة الزيجة (Homozygote) بالمرتبة الثانية (18.52%) وسجلت الاصابة المركبة (Compound) بنسبة بلغت (7.41%) من الطفرات المدروسة.

 

Molecular Identification of some Mutations Associated with Beta-Thalassemia in Kerbala Governorate

Thalassemia is hereditary anemia mostly common in the Mediterranean, the equatorial, or near equatorial regions of Africa and Asia. They are classified according to which particular globin chain(s) is/are produced in a reduced amount: a, b, db, d, and gd thalassemia. In the Kerbalaa Governorate  more than 600 patients have been diagnosed with β-thalassemia, they are currently being transfused and managed in local hospitals.

         The importance of this study is investigating of some mutations that cause beta-thalassemia, hematological examinations and estimation of Hb concentrations, quantitative and qualitative. As well as study the demographics of the studied samples in the holy Kerbalaa Governorate.

         Blood samples were collected from (36) patients with major phenotype and (20) patients with intermedia from thalassemia center in the holy Kerbalaa Governorate, with compared with (20) apparently healthy people.

          Distribution of samples according to some parameters were studied including :- age, sex, phenotype, parents relationship and the thalassemic brothers and/or sisters to evaluate the effects of these indicators on the diversity in the studied groups.

         The blood groups were determined for all samples, the relationships between blood groups and phenotypes of beta thalassemia were studied, the results show there was a significant  differences between blood groups and phenotypes :- The results revealed  that there was significant statistical correlation between beta – thalassemia major and blood groups B & O; and between beta-thalassemia intermedia & blood group A.

         Estimation of Hb concentrations ,quantitative and qualitative Hb analyses by Hb electrophoresis  to determine the Hb types (HbF, HbA and HbA2). The results show there was a significant differences between studied groups.

               The complete blood picture for all samples were determined including (RBC count, WBC count, blood platelet count, hematocrit  (HCT), Mean cell volume (MCV), Mean cell hemoglobin (MCH) and Mean cell hemoglobin concentration (MCHC).

          The results revealed significant statistical differences between patients groups and apparently healthy individuals for all studied parameters except WBC counts.

        Blood samples were subjected for DNA isolation , the molecular diagnosis of four types of beta thalassemia mutations IVS1-110 (G>C), CD 8/9(+G), – 87 (+G) and CD 41/42 (- TCTT)  using a PCR based  technique called ARMS (Amplification Refractory Mutation System)

          The study showed that IVS1-110 was a common mutation in studied samples. CD8/9 (+G) mutation was detected for the first time in the holy  Kerbalaa Governorate were as – 87(C> G) mutation diagnosed for the first time in Iraq. These study also revealed that CD 41/42 mutation not diagnosed within studied samples.

           The geographical distribution of positive diagnosed patients was studied to reveal the distribution of beta thalassemia mutation. The center of Kerbalaa city has a first order in the mutations quantity and quality.

          The study showed that the highest percentage in the children with parents were related and the highest percentage of major phenotype from first degree related parents.

          The study showed that (55.66%) of the patients studied samples have thalassemic brothers and/ or sisters with (9.26%) were dead.

          The study found that the highest percentage of thalassemic genotype was heterozygote 20(74.07%) and in second order was homozygote 5(18.52%) with compound heterozygote at 2(7.41%) was recorded.