University of Kerbala
اسم الباحث : حـــوراء عبـــد الحمــيد محـــسن
اسم المشرف : أ.م.د. زينــب نـــزار جــواد : أ.م.د. هبـــة علـــوان عبـــد الســـلام
الكلمات المفتاحية :
الكلية : كلية التربية للعلوم الصرفة
الاختصاص : علوم الحياة/علم الحيوان
سنة نشر البحث : 2023
تحميل الملف : اضغط هنا لتحميل البحث
الخلاصة
تهتم الدراسة الحالية بالكشف عن دور أعداد نسخ الحامض النووي المايتوكونديري لجين (ND1) ubiquinone oxidoreductase 1 / NADH و طفرات الجين BRAF لدى مرضى سرطان الغدة الدرقية كونها من الجينات المهمة والمؤثرة في حدوث الاصابة بالامراض ومنها السرطانات كما في سرطان الغدة الدرقية كما تمت دراسة بعض عوامل الخطورة مثل الجنــــــس و التاريـــخ العائلــي للاصابـــة بالمـــرض و التدخيـــــن و العمـــــــر وارتفــاع ضغـــط الــــدم لمعرفة تأثيرها على الاصابة بسرطان الغدة الدرقية.
تناولت الدراسة ايضاً بعض المعايير الفسلجية و الهرمونية لمجموعتي المرضى والأصحاء لبيان اهميتها في تشخيص المرض وهي قياس مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية (TSH) Thyroid-stimulating hormone و هرمونات الغدة الدرقية (T3) Triiodothyronine ، (T4) Thyroxin ، calcitonin ومستويات مضادات الأكسدة الجلوتاثيون glutathione ودرست العلاقة بين سرطان الغدة الدرقية و الإجهاد التأكسدي المستضد السرطاني المضغي carcinogenic embryonic antigen CEA والمانول داي الديهايد Malondialdehyde MDA و جُمعت العينات الخاصة بهذه الدراسة من 50 مريض مصاب بسرطان الغدة الدرقية من مراجعي مؤسسة وارث لعلاج الاورام في محافظة كربلاء المقدسة بعد التشخيص وقبل الجراحة و 50 شخص من الاصحاء مظهرياً كمجموعة سيطرة للفترة مابين 1 أيلول2022 ولغاية 1 كانون الاول 2022.
تم استخلاص الـ (DNA) Deoxyribose nucleic acid من الدم لمجموعتي المرضى والاصحاء وأجري الكشف الجزيئي عن أعداد نسخ الحامض النووي المايتوكونديري للجين ND1 مقارنة مع الجين الطبيعي (Housekeeping gene) HGBو طفرات الجين BRAF باستخدام (REAL TIME PCR) (QPCR) و Sequencing اذ اظهرت نتائج الكشف الجزيئي في جين ND1 بالمقارنة مع الجين الطبيعي HGBارتباط معنوي عالي عند مستوى المعنوية (p ≤ 0.01) و( p ≤ 0.05) بالنسبة لتحليل cycle threshold CT بين المصابين بسرطان الغدة الدرقية والاصحاء منه ، كما تم تحديد تتابع القواعد النيتروجينية في جين الدراسة BRAF والمضخم بواسطة الـ PCR و قورنت النتائج مع البيانات التي تم الحصول عليها من Gene bank باستخدام موقع (NCBI Blast ) في موقع Gene bank (NCBI) National Center for Biotechnology Information وكان عدد العينات 5 للمرضى مقابل عينة سيطرة واحدة لكلا شريطي الـDNA الامامي والخلفي (Forward & Reverse) اذ تم اكتشاف اثنين من التعــــــددات الشكلية الــــ( SNPs) single nucleotide poly-morphisms و كان التعــــــدد الشكلي الاول rs2128998351 في الموقع (A113G ) بإستبدال الأدينين بالجوانين وكان التغاير في ثلاثة عينات و ذو طراز وراثي متباين الزيجة heterozygous ، و الـتعدد الشكلي الثاني مفرد النيوكلتيد ( SNPs) هو rs2128998142 في الموقع T164A باستبدال الثايمين بالأدينين وكان التغاير في عينتين بطراز وراثي متباين الزيجة heterozygous اذ أظهرت هذه الدراسة أن الـSNP كان مرتبطا بالمرض المستهدف بسبب وجوده في عينات من المرضى لم تلاحظ في عينات الاصحاء ،ولم تربط أي دراسة سابقة هذين الـ SNPs مع سرطان الغدة الدرقية في العراق.
كما اشارت النتائج الحالية الى وجود علاقات مختلفة بين العوامل المدروسة اذ اظهرت فروقات ذات دلالة احصائية عند مستوى المعنوية (p ≤ 0.01) و( p ≤ 0.05) للجنس والتدخين والعمر مع الاصابة بسرطان الغدة الدرقية بينما لم تظهرعلاقة للتاريخ العائلي و ارتفاع ضغط الدم مع الاصابة بالمرض ، كما اوجدت الدراسة ارتفاع في مستوى الهرمون المحفز للغدة الدرقية TSH و هرمونات الغدة الدرقية (T3-T4-calsitonin) في الدم بمقارنتها مع مجموعة الاصحاء اذ كانت أعلى بكثير مما لدى المرضى ، كما و تمت دراسة مستويات مضادات الأكسدة (الجلوتاثيون) ووجد انخفاض في مستوياته ودرست العلاقة بين سرطان الغدة الدرقية و الإجهاد التأكسدي (المستضد السرطاني المضغي والمانول داي الديهايد) اذ لوحظت زيادة في مستويات الإجهاد التأكسدي بما في ذلك مستضد السرطاني المضغي والمانول داي الديهايد.
Variations in ND1 Gene and BRAF Gene and Physiological Parameters in Thyroid Cancer Patient’s
Abstract
The current study is concerned with revealing the role of mitochondrial DNA copies of the ND1 gene and BRAF gene mutations in thyroid cancer patients as one of the important genes affecting the occurrence of diseases, including cancers, as in thyroid cancer, some risk factors such as gender, family history of the disease, smoking, age and high blood pressure were also studied to find out their impact on thyroid cancer.
the study also dealt with some physiological and hormonal criteria for the paitent and control groups to show their importance in diagnosing the disease, which is measuring the level of thyroid-stimulating hormone (TSH) Thyroid-stimulating hormone and thyroid hormones (T3) Triiodothyronine, (T4) thyroxin, calcitonin and antioxidant levels (glutathione) and studied the relationship between thyroid cancer and oxidative stress (carcinogenic embryonic antigen and Malondialdehyde). samples for this study were collected from 50 patients with thyroid cancer from the Warith Foundation for Oncology in the Holy Karbala after diagnosis and before surgery and 50 people from control group Between 1- September 2022 until 1-December 2022.
DNA was extracted from the blood of the cancer patient and control groups, and molecular detection was performed on the number of mitochondrial DNA copies of the ND1 gene compared with the natural gene HGB and BRAF gene mutations using the techniques of (REAL TIME PCR) (QPCR) and Sequencing, where the results of molecular detection in the ND1 gene compared to the normal gene HGB showed a high significant association at the level of significance ( p≤ 0.01) and (p≤ 0.05 ) for cycle threshold CT analysis among thyroid cancer patients and control groups. The sequence of nitrogenous bases in the BRAF and amplified study gene was also determined by PCR and the results were compared with the data obtained from Gene bank using the NCBI Blast website at the Gene bank website (NCBI) and the number of samples was 5 for patients compared to 1 control sample for both Forward & Reverse DNA strands. Two morphological polymorphisms (SNP) were discovered, the first is rs2128998351 at the site (A113G) by replacing adenine with guanine, and the heterogeneity was in three samples and has a heterozygous genetic pattern, and the second mononucleated polymorphism (SNPs) is rs2128998142 at site T164A by replacing thymine with adenine and the heterogeneity was in two samples with heterozygous, This study showed that SNP was associated with the thyroid cancer due to its presence in samples of patients that were not observed in control samples, and no previous study linked these two SNPs with thyroid cancer in Iraq.
The current results indicated the existence of different relationships between the studied factors, where they showed statistically significant differences at the level of moral ( p≤ 0.01) and (p≤ 0.05 ) for sex, smoking and age with thyroid cancer, while no relationship with family history and high blood pressure with thyroid cancer has been shown, where it was found by comparing them with the control group that they were much higher than in patients, The relationship between thyroid cancer and oxidative stress (embryonic carcinogenic antigen and Malondialdehyde) was studied, and an increase in oxidative stress indicators including carcinogenic embryonic antigen and Malondialdehyde
