التشخيص المظهري والجزيئي لأنواع الفطر Aspergillus spp. المعزولة من الهواء لمناطق محدده بين الحرمين في محافظة كربلاء المقدسة

اطروحة دكتوراه

اسم الباحث : محمد حكم عطوان بنيان الساعدي

اسم المشرف : أ.د بان طه محمد

الكلمات المفتاحية :

الكلية : كلية التربية للعلوم الصرفة

الاختصاص : علوم الحياة-النبات

سنة نشر البحث : 2024

تحميل الملف : اضغط هنا لتحميل البحث

تم دراسة تلوث الهواء الجوي بانواع الفطر Aspergillus spp. لمدينة كربلاء المقدسة في منطقة ما بين الحرمين خلال شهر تشرين الأول لسنة 2022، جمعت العينات باستخدام جهاز اخذ العينات الفولاذي (Air Sampler System) المستخدم في جمع الفطريات من الهباء الجوي. قد اظهر الجهاز الافضليه في جمع العينات من خلال عدد ونوع الفطريات التي يصطادها من الهواء الجوي مقارنة بالطريقة التقليدية. تضمنت الدراسة عزل وتنقيه انواع Aspergillus المأخوذ من الهواء بواسطة الجهازبعد زراعتها على ثلاث اوساط مختلفة تمثلت بوسط PDA والزابك والمالت. شخصت مظهريا بالاعتماد على الطرائق التقليدية التي تعتمد على المظهر الخارجي للمستعمرة وشكل الفطر تحت المجهر الضوئي ، ومن ثم تشخيصها جزيئيا وايجاد العلاقة الوراثية للعزلات باستخدام تقنيه التضاعف العشوائي متعددة الاشكال للدنا (ايجاد البصمة ال تم دراسة تلوث الهواء الجوي بانواع الفطر Aspergillus spp. لمدينة كربلاء المقدسة في منطقة ما بين الحرمين خلال شهر تشرين الأول لسنة 2022، جمعت العينات باستخدام جهاز اخذ العينات الفولاذي (Air Sampler System) المستخدم في جمع الفطريات من الهباء الجوي. قد اظهر الجهاز الافضليه في جمع العينات من خلال عدد ونوع الفطريات التي يصطادها من الهواء الجوي مقارنة بالطريقة التقليدية. تضمنت الدراسة عزل وتنقيه انواع Aspergillus المأخوذ من الهواء بواسطة الجهازبعد زراعتها على ثلاث اوساط مختلفة تمثلت بوسط PDA والزابك والمالت. شخصت مظهريا بالاعتماد على الطرائق التقليدية التي تعتمد على المظهر الخارجي للمستعمرة وشكل الفطر تحت المجهر الضوئي ، ومن ثم تشخيصها جزيئيا وايجاد العلاقة الوراثية للعزلات باستخدام تقنيه التضاعف العشوائي متعددة الاشكال للدنا (ايجاد البصمة الوراثية ) .شخصت عشرة عزلات من الفطر Aspergillus تمثلت بكل من Aspergllus fumigatus, Aspergllus terreus, Aspergllus quadrilineatus ,Aspergllus latus, Aspergllus striatus, Aspergllus sp وتم تاكيد تشخيصها جزيئيا باستخدام تقنية الـ PCR .بينت النتائج تسجيل نوعين من الفطريات المدروسة لأول مره في العراق حسب تسجيل البنك الجيني للفطريات وهما كل من A. latusو A. striatus وحسب التسلسل OR497756 و OR501409على التوالي. أعطت النتائج نسب ظهور بلغت 31.57% وبعدها المنطقة المسقوفة بنسبة 28.92% والتي اشارت الى انها اقل تلوثا بفارق معنوي. سجل الفطر fumigatus .A اعلى تردد بلغ 44.57% في كلتا المنطقتين في حين سجل الفطرA. striatus اقل تردد بنسبه 6.19% وبينت النتائج لموقع المنطقة المفتوحة ان الانواع,A. fumigatus A .terreu،A. quadrilineatus كانت الأكثر كثافة في التوزيع . بينما كانت الانواع الاقل كثافة هي A. straitus وA.latus و ان أنواع الجنس Aspergillus متمثلة بـ fumigatus A و A.terreu و A. quadrilineatus كانت هي الأكثر كثافة في معظم عينات الهواء سواء من داخل المناطق المسقوفة او خارجها خلال فترة الدراسة .

وراثية ) .شخصت عشرة عزلات من الفطر Aspergillus تمثلت بكل من Aspergllus fumigatus, Aspergllus terreus, Aspergllus quadrilineatus ,Aspergllus latus, Aspergllus striatus, Aspergllus sp وتم تاكيد تشخيصها جزيئيا باستخدام تقنية الـ PCR .بينت النتائج تسجيل نوعين من الفطريات المدروسة لأول مره في العراق حسب تسجيل البنك الجيني للفطريات وهما كل من A. latusو A. striatus وحسب التسلسل OR497756 و OR501409على التوالي. أعطت النتائج نسب ظهور بلغت 31.57% وبعدها المنطقة المسقوفة بنسبة 28.92% والتي اشارت الى انها اقل تلوثا بفارق معنوي. سجل الفطر fumigatus .A اعلى تردد بلغ 44.57% في كلتا المنطقتين في حين سجل الفطرA. striatus اقل تردد بنسبه 6.19% وبينت النتائج لموقع المنطقة المفتوحة ان الانواع,A. fumigatus A .terreu،A. quadrilineatus كانت الأكثر كثافة في التوزيع . بينما كانت الانواع الاقل كثافة هي A. straitus وA.latus و ان أنواع الجنس Aspergillus متمثلة بـ fumigatus A و A.terreu و A. quadrilineatus كانت هي الأكثر كثافة في معظم عينات الهواء سواء من داخل المناطق المسقوفة او خارجها خلال فترة الدراسة .

Phenotypic and molecular diagnosis of Aspergillus spp fungi isolated from the air in specific areas between the Two Holy Mosques in the Holy Karbala Governorate

Atmospheric air pollution with Aspergillus fungus species was studied for the holy city of Karbala in the area between the Two Holy Mosques during the month of October of the year (2022). Samples were collected using a steel sampling device (Air Sampler System) used to collect fungi from aerosols. The device showed superiority in collecting samples through the number and type of fungi it caught from the air compared to the traditional method. The study included isolating and purifying Aspergillus species taken from the air using the device, after cultivating them on three different media, including PDA, Zabac, and Malt media. They were diagnosed phenotypically based on traditional methods that rely on the external appearance of the colony and the shape of the fungus under an optical microscope, and then diagnosed molecularly and the genetic relationship of the isolates was found using the polymorphic DNA random replication technique (finding the genetic fingerprint). Ten isolates of the fungus Aspergillus were identified, including: Aspergllus fumigatus, Aspergllus terreus, Aspergllus quadrilineatus ,Aspergllus latus, Aspergllus striatus, Aspergllus spp. Its diagnosis was confirmed molecularly using PCR technology. The results showed the registration of two types of fungi studied for the first time in Iraq, according to the registration of the Fungi Gene Bank, which are: A. latus and A. striatus, according to sequences OR497756 and OR501409, respectively. The results gave an appearance rate of 31.57%, followed by the covered region with a rate of 28.92%, which indicated that it was less polluted by a significant difference.The fungus A. fumigatus recorded the highest frequency of 44.57% in both regions, while the fungus A. striatus, with the lowest frequency at 6.19%. The results for the open region location showed that the species, A. fumigatus A. terreu,A. quadrilineatus It was the most densely distributed. While the least dense species were A. straitus and A.latus, and the species of the genus Aspergillus, represented by A. fumigatus, A. terreu, and A. quadrilineatus, were the most dense in most air samples, whether inside or outside the covered regions during the study period.