علاقة تغايرات جين TLR7 مع بعض المؤشرات الكيموحيوية بين النساء المصابات بسرطان الثدي

رسالة ماجستير

اسم الباحث : زهراء ماجد جاسب

اسم المشرف : أ.د. جودت نوري غائب

الكلمات المفتاحية :

الكلية : كلية العلوم الطبية التطبيقية

الاختصاص : التحليلات المرضية

سنة نشر البحث : 2024

تحميل الملف : اضغط هنا لتحميل البحث

الخلاصة

أجريت الدراسة الحالية في قسم المختبرات السريرية / كلية العلوم الطبية التطبيقية / جامعة كربلاء خلال الفترة من تشرين الثاني 2022 الى نيسان 2024. هدفت الدراسة إلى إلقاء الضوء على العلاقة بين تباين جين TLR7 ومستوى بعض المؤشرات الكيموحيوية (CA15-3 و CEA و CA125 و CA27-29) لدى مريضات سرطان الثدي من النساء العراقيات. تم اخذ 100 امرأة متطوعة , في هذه الدراسة ، 50 امرأة مصابة بسرطان الثدي ، في المقابل تم اخذ 50 امرأة ظاهراً تتمتع بصحة جيدة , تتراوح أعمارهن بين 29 إلى 75 عاماً في وقت التحقيق.
تم جمع عينات الدم من المتطوعات في مركز الامام الحسين (ع) لعلاج الأورام وأمراض الدم في مدينة كربلاء المقدسة / العراق ، وتم التوقيع على الموافقة الأخلاقية من قبل كل متطوع.
كانت الدراسة عبارة عن دراسة وراثية سكانية، أجريت على مجموعتين من العينات. تم التحقيق في تباين جين TLR7 بواسطة طريقة التسلسل Sanger. تم قياس مستويات ( CA15-3 و CEA و CA125 و CA27-29) في المصل بواسطة تقنية (ELISA).
أظهر التحليل الإحصائي فروقًا مهمة إحصائياً (فروق معنوية) عند مقارنة مستويات علامات الورم الأربعة وهي (CEA و CA125 و 15-3 CA و 27-29 CA) في المصل بين مجموعة السيطرة ومجموعة المرضى (P<0.001).
أظهر التحليل الجيني لنتائج 20 عينة )تم اختيارها من عينات مرضى سرطان الثدي( اختلافات متنوعه في شكل جين TLR7 , وكان عدد المتغيرات الموجودة في العينات مختلفًا من عينة إلى أخرى، حيث اظهرت جميع العينات اختلافات متعددة في التسلسل الجيني لمنطقة Exon4 ، بينما اظهرت 6 من أصل 20 عينة اختلافات مزدوجة في تسلسلها الجيني و اظهرت العينات الـ 14 المتبقية اختلافات متعددة في التسلسل الجيني لمنطقة Intron2.

تم تقسيم المتغيرات المكتشفة إلى مجموعتين، متغيرات مسجلة مسبقًا (4 متغيرات (1 لمنطقة Exon4 و3 لمنطقة Intron2)( ، ومتغيرات جديدة غير مسجلة (13 متغيرًا (8 لمنطقة Exon4 و 5 لمنطقة Intron2)(.
تم اكتشاف المتغيرات المسجلة مسبقًا )12888260 (G/A في 10 عينات تم اكتشافها في منطقة Exon4 ، بينما في منطقةIntron2 تم اكتشاف المتغيرات (12871738 A\G ، A\C 12871850 ، 12871888 (T\Aفي 18 عينة.
تم اكتشاف المتغيرات الجديدة غير المسجلة (12888260 T/G , 12888246 T/G , 12888294 A/G , 12888276 A/T , 12888234 T/G , 12888269 G/A , 12888351 A/G , 12888211 A/C ) في 12 عينة تم اكتشافها في منطقة Exon4 ، بينما في منطقةIntron2 تم اكتشاف المتغيرات (12871759 T/G , 12871794 G/C , 12871741 A/T , 12871768 G/C , 12871764 A/G) في 17 عينة.
تم التحقيق في تأثيرات الاختلافات الجينية TLR7 على عوامل الدراسة (CA15-3 و CEA و CA125 و CA27-29) من خلال مقارنة مستوى أو كمية كل عامل في العينات التي تشترك في نفس الاختلاف. من خلال تحليل النتائج أظهرت أن المتغير(12871749 G/C) لمنطقة Intron2 كان مرتبطًا إلى حَدٍّ ما بشكل سلبي إحصائيًا مع مستويات CEA (معامل الارتباط الثنائي النقطة = -0.396، p = 0.03). علاوة على ذلك، يعرض التحليل الإحصائي وجود فروقاً ذات دلالة إحصائية (فروق معنوية) (p = 0.015) بين المتغير (12888211 A/C) لمنطقة 4 ExonوقيمةCA125 ، وكان التفاعل ذو ارتباط متوسط (معامل الارتباط الثنائي النقطي=- 0.442). أظهرت النتائج ارتباط المتغير (12871764 A/G) لمنطقة Intron2 بشكل معتدل بمستويات علامة الورم CA15-3 (معامل الارتباط الثنائي النقطة = -0.385) وكان المتغيران مرتبطين بشكل كبير إحصائيًا (p = 0.036).
أظهرت نتائج منطقة Exon4 فروقاً ذات دلالة احصائية (فروق معنوية) بين نفس المجموعتين في مستوى CEA قيمة (p = 0.015)، بينما أظهرت النتائج فروقاً غير معنوية بين المجموعتين مقسمة حسب عدد الطفرات (<6 و>6) في مستوى CA125، CA15-3 وCA27-29 بقيمةp (0.44)، (0.96) و (0.48) على التوالي. أظهر التحليل الإحصائي وجود فروقاً غير مهمة (فروق غير معنوية) بين المتغيرات الجديدة والمختلطة في مستوى (CEA وCA125 وCA27-29) بقيمة p (0.76) و(0.32) و(0.428) على التوالي. في حين أظهرت نتيجة CA 15-3 فروقاً ذات دلالة احصائية (فروق معنوية) بين المتغيرات الجديدة والمختلطة حيث كانت قيمة(0.02=p) في منطقة Exon4.

Association of TLR7 Gene Variants with Some Biochemical Markers among Breast Cancer Women

Abstract

The present study as a Case-Control Study was carried out in the Department of Clinical Laboratories / College of Applied Medical Sciences / University of Kerbala during the period from November 2022 to May 2024. The study aimed to shed light on the association between the variant of the TLR7 gene and serum level of some biochemical markers (CA15-3, CEA, CA125, and CA27-29) in breast cancer patients from Iraqi women. 100 women volunteers enlisted, 50 women with the breast cancer , in contrast 50 women included apparently healthy were enrolled in this study, with an age range of (29-75) years at the time of the investigation.
The blood samples were drawn from volunteers were recruited from AL-Imam AL-Hussein Center for Oncology and Hematology in Karbala city / Iraq , the ethical consent was signed by each volunteer. The study was a population genetic study, carried out on two group samples. The variants of the TLR7 gene were investigated by the Sanger sequencing method. The serum levels of) CA15-3, CEA, CA125, and CA27-29( were measured by enzyme linked immunosorbent assay (ELISA) technique. The statistical analysis displayed statistically significant differences when the serum levels of the four tumor markers namely )CEA, CA125, CA15-3, and CA27-29( were compared between control and patient groups (p<0.001).
The genetic analysis of the results of the 20 samples (selected from patient samples) showed different types of variants in the TLR7 gene. The number of variants present in the samples was different from one sample to another, the all 20 samples displayed multiple variants in their exon4 region sequences , while 6 out of 20 samples demonstrate double variants and the rest 14 samples displayed multiple variants in intron2 region sequences.
The detected variants were divided into two groups, previously registered variants (4 variants, 1 exon4 and 3 intron2), and novel non-registered variants (13 variants, 8 exon4 and 5 intron2).
The previously registered variants [12888260 G/A] was detected in Exon4 region in 10 out of 20 samples , while variants [12871738 A\G, 12871850 A\C, and 12871888 T\A] were detected in Intron2 region in 18 out of 20 samples. The novel non-registered variants [12888227 T\G, 12888234 T\G, 12888246 T\G, 12888294 A\G, 12888276 A\T, 12888269 G\A, 12888351 A\G, and 12888221 A\C] were detected in Exon4 region in 12 out of 20 samples, while variants [12871741 A\T, 12871749 G\C, 12871759 T\G, 12871764 A\G, and 12871768 G\C] were detected in Intron2 region in 17 out of 20 samples.
The effects of TLR7 gene variants on study parameters )CA15-3, CEA, CA125, and CA27-29( were investigated and the results showed that the variant [12871749 G/C] of the intron2 region was moderately negatively and statistically significantly correlated with the CEA tumor marker serum levels (point biserial correlation coefficient = -0.396 , p value = 0.03). Furthermore, the statistical analysis showed a statistically significant correlation (p value = 0.015) between the variant [12888221 A/C] of the exon4 region and the CA125 tumor marker serum value, the interaction was of an intermediate correlation (point biserial correlation coefficient = -0.442).
The variant [12871764 A/G] of the intron2 region was moderately associated with the CA15-3 tumor marker levels (point biserial correlation coefficient = -0.385) and the two variables were statistically significantly associated (p value = 0.036).

The results of Exon4 region displayed significant differences between the same groups in the level of CEA (p value = 0.015), while the result displayed non-significant differences between the two groups divided according to number of variants (<6 and >6 variants) in the level of CA125, CA15-3, and CA27-29 with a p value 0.44, 0.96, and 0.48 respectively.
The statistical analysis indicated non-significant differences between new and mixed variants in the level of CEA, CA125, and CA27-29 with a p value 0.76, 0.32, and 0.428 respectively. While the result of CA15-3 displayed significant differences between new and mixed variants where )p value = 0.02( in Exon4 region.